Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprfA2A8L5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms