Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms