Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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