Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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