Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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