Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Gm2788-206ENSMUST00000210463 1338 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms