Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Vmn1r54Q9EPB8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vmn1r54Q9EPB8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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