Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mrpl4Q9DCU6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms