Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms