Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hmgn3Q9DCB1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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