Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms