Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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