Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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