Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms