Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms