Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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