Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms