Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zbed3Q9D0L1 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zbed3Q9D0L1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zbed3Q9D0L1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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