Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms