Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms