Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms