Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg3Q9CPX6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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