Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sike1Q9CPR7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms