Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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