Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms