Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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