Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Spef1Q99JL1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms