Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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