Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms