Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39cQ8VE09 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms