Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh9Q8K5C8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rdh9Q8K5C8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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