Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms