Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms