Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms