Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc43a2Q8CGA3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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