Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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