Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx8Q8CFD4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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