Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms