Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrif1Q8CDD9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms