Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vwa8Q8CC88 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vwa8Q8CC88 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms