Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SynpoQ8CC35 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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