Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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