Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms