Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms