Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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