Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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Tnrc6bQ8BKI2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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Tnrc6bQ8BKI2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Tnrc6bQ8BKI2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Tnrc6bQ8BKI2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnrc6bQ8BKI2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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