Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-M10.4Q85ZW8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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