Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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