Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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