Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms